Главная святыня храма — его уникальная история, переплетение сакрального и мирского. Здесь -
- Заседал купеческий суд под надзором святого.
- Хранились эталоны мер и весов как символы честной торговли.
- Копились богатства «Иванского ста», делавшие Новгород одним из богатейших городов Европы.
В память о святителе Иоанне Новгородском ежегодно 7 сентября совершается празднование, а в Софийском соборе Новгорода покоятся его святые мощи.